Раздельный учёт НДС на УСН: типичные ошибки

4 мая 2026  ·  Наталья Свияжская, эксперт по учёту и отчётности НДС

Почему упрощенец вообще обязан вести раздельный учёт НДС

Распространённое возражение звучит так: «Я на упрощёнке — НДС меня не касается». С 2025 года это неверно для большинства предпринимателей, чей доход превысил 20 млн ₽ за предыдущий год (п. 1 ст. 145 НК РФ, 176-ФЗ в ред. 425-ФЗ, действует с 01.01.2026). Такой упрощенец становится плательщиком НДС — и обязан применять правила главы 21 НК РФ в полном объёме.

Раздельный учёт возникает в двух ситуациях. Первая: упрощенец выбрал стандартную ставку 22% (п. 3 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ) и одновременно ведёт операции, освобождённые от НДС по ст. 149 НК РФ. Вторая: на предприятии есть реализация по разным ставкам — например, 10% на продукты питания и 22% на прочие товары. В обоих случаях ст. 170 НК РФ требует вести раздельный учёт входного НДС: распределять, какая его часть относится к облагаемым операциям (и принимается к вычету), а какая — к необлагаемым (и включается в стоимость).

При выборе спецставок 5% или 7% (пп. 1–2 п. 8 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ) вычетов нет вовсе — весь входной НДС включается в затраты. Раздельный учёт входного налога в этом случае формально проще, однако ошибки с классификацией операций и выставлением счетов-фактур остаются.

Пять ключевых терминов и ошибки в их применении

1. Порог освобождения от НДС

Что это. Упрощенец освобождён от НДС, если доход за предыдущий год не превысил 20 млн ₽ (п. 1 ст. 145 НК РФ, 176-ФЗ в ред. 425-ФЗ). Порог заморожен на уровне 20 млн ₽ на несколько лет — конкретные годы дальнейшего снижения уточняются [VERIFY]. Для ИП с 25.04.2026: проценты по банковским вкладам не учитываются, если доход ИП за 2025 год не превысил 60 млн ₽ (104-ФЗ).

Типичная ошибка. Бухгалтер считает доход по кассовому методу и «не замечает» авансы декабря, поступившие на счёт. В результате порог де-факто превышен, но декларация по НДС не подаётся. Налоговый орган при камеральной проверке (ст. 88 НК РФ) выявляет расхождение через АСК НДС и банковскую выписку — и начисляет НДС расчётным методом с суммы выручки, штраф 20% (п. 1 ст. 122 НК РФ) плюс пени.

Как правильно. Доход для целей ст. 145 НК РФ определяется по правилам главы 26.2 НК РФ (кассовый метод), но все поступления на счёт и в кассу за год учитываются в полном объёме. Проверяйте порог не позднее 31 декабря — до начала следующего налогового периода.

2. Спецставка НДС (5% и 7%) и период её применения

Что это. Спецставки 5% (расчётная 5/105) и 7% (расчётная 7/107) закреплены в п. 8 ст. 164 НК РФ. Ставка 5% применяется, пока доход не превышает 272,5 млн ₽ в год (с учётом дефлятора 1,090, приказ МЭР № 734 от 06.11.2025). При превышении — переход на 7%, который действует до 490,5 млн ₽. Выбранная спецставка применяется 12 последовательных кварталов без права досрочного отказа (п. 9 ст. 164 НК РФ). Для впервые перешедших на НДС действует окно однократного отказа в течение 4 налоговых периодов (абз. 2 п. 9 ст. 164, 425-ФЗ).

Типичная ошибка. Компания выбрала ставку 5% и в середине второго квартала «передумала» — решила перейти на 22%, чтобы получить вычеты. Бухгалтер начинает выставлять счета-фактуры с НДС 22%. Это нарушение: ставка зафиксирована на 12 кварталов, и налоговый орган вправе пересчитать НДС исходя из той ставки, которую налогоплательщик задекларировал при выборе.

Как правильно. До выбора ставки — смоделировать налоговую нагрузку минимум на три года. Если поставщики в основном плательщики НДС и входной налог значителен, стандартная ставка 22% с вычетами может быть выгоднее даже при большей номинальной ставке. Зафиксировать выбор ставки в учётной политике до начала первого квартала её применения.

3. Счёт-фактура на УСН

Что это. Упрощенец-плательщик НДС обязан выставлять счёт-фактуру покупателю в течение 5 календарных дней с даты отгрузки или получения аванса (ст. 169 НК РФ). Счёт-фактура — единственный документ, дающий покупателю право на вычет.

Типичная ошибка — тройная. Первая: упрощенец выставляет счёт-фактуру с НДС, хотя применяет спецставку 5% и имеет освобождение по отдельным операциям — в итоге перемешивает ставки в одном документе. Вторая: не выставляет счёт-фактуру на аванс (полагая, что на УСН это необязательно), а потом не может подтвердить момент возникновения обязательства. Третья: при смене ставки в середине периода выставляет корректировочные счета-фактуры задним числом — это нарушает ст. 168–169 НК РФ и лишает покупателя вычета.

Как правильно. Настроить шаблон счёта-фактуры в учётной системе отдельно для каждой применяемой ставки. При совмещении ставок (например, 10% и 22%) — оформлять разные строки в одном счёте-фактуре с чёткой разбивкой по ставкам. Авансовые счета-фактуры выставлять обязательно.

4. Восстановление НДС при переходе

Что это. При переходе с ОСНО на УСН (или при получении освобождения по ст. 145 НК РФ) налогоплательщик обязан восстановить ранее принятый к вычету входной НДС по товарам, работам, услугам и основным средствам, которые будут использоваться в периоде применения УСН или освобождения (п. 3 ст. 170 НК РФ). Восстановление производится в последнем квартале перед переходом.

Типичная ошибка. Компания переходит на спецставку 5% и не восстанавливает НДС по остаткам товаров на складе, купленным при ОСНО с вычетом 22%. Инспекция при проверке восстанавливает налог самостоятельно, доначисляет сумму с пенями и штрафом 20% по п. 1 ст. 122 НК РФ.

Как правильно. До перехода — провести инвентаризацию товарных остатков, незавершённого производства и основных средств. Рассчитать НДС к восстановлению. По основным средствам восстановление производится пропорционально остаточной стоимости. Отразить восстановление в декларации за квартал, предшествующий переходу.

5. Уведомление об освобождении от НДС

Что это. Упрощенец, чей доход за предыдущий год не превысил 20 млн ₽, вправе применять освобождение от НДС по п. 1 ст. 145 НК РФ. Освобождение носит уведомительный характер: подать уведомление в налоговый орган нужно не позднее 20-го числа месяца, начиная с которого используется освобождение.

Типичная ошибка. Бухгалтер уверен, что освобождение применяется «автоматически» при соблюдении порогового условия, и не подаёт уведомление. Позиция судов при оценке подобных ситуаций неоднородна: часть решений признаёт освобождение действующим при фактическом соблюдении условий, часть — настаивает на уведомительной процедуре как обязательной. Безопаснее — уведомить в срок.

Как правильно. До начала каждого нового года проверять доход за предыдущий период. Если он не превысил 20 млн ₽ — подать уведомление до 20-го числа первого месяца года применения освобождения. Форму уведомления уточнять по актуальной редакции приказа ФНС [VERIFY].

• Проверьте доход за предыдущий год и сравните с порогом 20 млн ₽ (п. 1 ст. 145 НК РФ). Для ИП: убедитесь, что проценты по вкладам корректно исключены или включены в базу (104-ФЗ).
• Зафиксируйте выбранную ставку (5%, 7% или 22%) в учётной политике до начала первого квартала её применения — и помните о блокировке на 12 кварталов.
• Настройте шаблоны счетов-фактур отдельно для каждой ставки; для авансов — включите обязательное формирование авансового счёта-фактуры.
• При переходе — проведите инвентаризацию остатков и рассчитайте НДС к восстановлению по п. 3 ст. 170 НК РФ.
• Если претендуете на освобождение по ст. 145 НК РФ — подайте уведомление до 20-го числа первого месяца применения (форму уточните по актуальному приказу ФНС [VERIFY]).

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Нормы НК РФ применяются с учётом конкретных обстоятельств. Для оценки вашей ситуации обратитесь к специалисту бюро.