Раздельный учёт НДС на УСН: переходный период

10 мая 2026 — Виктор Аршинов, эксперт по НДС

Почему «я на упрощёнке» больше не аргумент

Самое распространённое заблуждение, с которым сталкиваются упрощенцы в 2026 году: «НДС — это для больших, меня не касается». До 2025 года так и было. Теперь — нет.

С 2025 года 176-ФЗ от 12.07.2024 сделал организации и ИП на УСН полноценными плательщиками НДС — если они не подпадают под освобождение. Порог освобождения с 2026 года — 20 млн рублей дохода за предыдущий год (п. 1 ст. 145 НК РФ в редакции 425-ФЗ от 28.11.2025). Порог заморожен на уровне 20 млн рублей на несколько лет; конкретные годы возможного дальнейшего снижения уточняются [VERIFY].

Что это означает на практике: если в 2025 году ваша выручка перешла отметку 20 млн рублей, то 1 января 2026 года вы проснулись плательщиком НДС. Никакого заявления подавать не надо — статус присваивается автоматически. И с этого момента начинается переходный период, в котором цена ошибки — штраф 20% от неуплаченного налога по п. 1 ст. 122 НК РФ, а при умысле — 40% по п. 3 ст. 122 НК РФ.

Три пути для упрощенца: освобождение, спецставка или стандартная ставка

Как только вы понимаете, что стали плательщиком НДС, первый вопрос — в каком режиме работать. Вариантов три, и каждый имеет свою математику.

Освобождение по ст. 145 НК РФ (автоматическое). Применяется, если доход за предыдущий год не превысил 20 млн рублей. Никакого НДС, никаких деклараций по НДС в общем случае, никакой книги покупок. Но и входящий НДС от поставщиков к вычету не берётся — он ложится в стоимость товара или услуги. Покупатели, которым нужны вычеты, будут смотреть на вас с подозрением: счёт-фактура выставляется с пометкой «Без НДС».

Спецставка 5% (пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ). Применяется, если доход за текущий год не превышает 272,5 млн рублей (лимит с учётом дефлятора 1,090 на 2026 год, приказ МЭР от 06.11.2025 № 734). Ставка низкая, но права на вычет входящего НДС нет. Ставка связывает на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ) — выйти раньше не получится, кроме случая однократного отказа в первые 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ от 28.11.2025).

Спецставка 7% (пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ). Применяется при доходе до 490,5 млн рублей (лимит с дефлятором 1,090). Также без права на вычеты и также на 12 кварталов. Вычеты не применяются — входящий НДС включается в расходы.

Стандартная ставка 22% (п. 3 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ от 28.11.2025, с 01.01.2026), расчётная 22/122. Дорого, зато полноценный вычет входящего НДС. Если у вас много поставщиков — плательщиков НДС и значительные закупки, математика нередко складывается в пользу стандартной ставки. Льготная ставка 10% (п. 2 ст. 164 НК РФ, расч. 10/110) применяется к отдельным категориям товаров и услуг (продукты, детские товары, лекарства и пр.) — для них вычеты тоже работают в стандартном порядке.

Раздельный учёт: когда он нужен и что в него входит

Раздельный учёт НДС на УСН в переходный период — это не отдельный налог и не новый регистр. Это способ организовать учёт так, чтобы правильно определить, какая часть входящего НДС принимается к вычету, а какая — нет.

Раздельный учёт становится обязательным, когда у вас одновременно есть операции, облагаемые НДС, и операции, освобождённые от налога (ст. 149 НК РФ), или операции по разным ставкам. Классический пример для упрощенца, перешедшего на НДС: часть реализации идёт по ставке 22%, часть — по льготной ставке 10%, часть — вообще освобождена по ст. 149 НК РФ (например, медицинские услуги или образование). В такой ситуации входящий НДС нужно распределить пропорционально — общий порядок раздельного учёта закреплён в ст. 170 НК РФ.

Для упрощенца, применяющего спецставку 5% или 7%, раздельный учёт в классическом смысле проще: вычетов нет в принципе, весь входящий НДС идёт на расходы (если применяется УСН «доходы минус расходы») или просто включается в стоимость (при УСН «доходы»). Но если у вас смешанная реализация — часть по спецставке, часть по стандартной — пропорциональный расчёт всё равно потребуется.

На практике суды при оценке обоснованности применения вычетов смотрят на то, ведётся ли раздельный учёт реально: есть ли разбивка в учётной политике, отражена ли она в регистрах, совпадает ли с первичкой. Формальная запись в учётной политике без подтверждения первичными документами рисков не снимает.

Матрица сценариев: что происходит в зависимости от вашей ситуации

Что перестраивать в учёте: конкретные шаги

Шаг 1. Проверьте статус. Посмотрите суммарный доход за 2025 год. Если он превысил 20 млн рублей — вы плательщик НДС с 01.01.2026. Доход ИП считается с учётом поправки 104-ФЗ от 25.04.2026: проценты по банковским вкладам в порог не включаются (для ИП с доходом не более 60 млн рублей за 2025 год).

Шаг 2. Выберите режим. Стандартная ставка 22% или спецставка 5%/7% — сравните налоговую нагрузку с учётом вашей доли входящего НДС от поставщиков. Если поставщики — плательщики НДС и доля закупок с НДС значительна, стандартная ставка с вычетами может снизить итоговую нагрузку. Если работаете с физлицами или с поставщиками-упрощенцами — спецставка, скорее всего, выгоднее.

Шаг 3. Пропишите учётную политику. Методику раздельного учёта нужно зафиксировать до начала применения режима. Если операций несколько видов — укажите, как вы распределяете входящий НДС: пропорционально выручке, по прямому учёту или иным способом. Основание — ст. 170 НК РФ.

Шаг 4. Настройте выставление счетов-фактур. С момента, когда вы стали плательщиком НДС, счёт-фактура обязателен по ст. 169 НК РФ. При освобождении — пометка «Без НДС». При спецставке или стандартной ставке — ставка и сумма НДС указываются отдельной строкой. Ошибка в счёте-фактуре лишает покупателя права на вычет, что создаёт претензии к вам как к продавцу.

Шаг 5. Подайте декларацию в срок. Декларация по НДС подаётся электронно до 25-го числа месяца, следующего за кварталом (п. 5 ст. 174 НК РФ). Уплата — до 28-го числа, тремя равными частями (п. 1 ст. 174 НК РФ). Просрочка декларации — штраф по п. 1 ст. 119 НК РФ: 5% в месяц, максимум 30%, минимум 1000 рублей.

Шаг 6. Ведите книги покупок и продаж. При стандартной ставке и при спецставках с правом на вычет — обязательные регистры. При освобождении по ст. 145 НК РФ — книга покупок не нужна. При спецставке 5%/7% без вычетов — книга продаж всё равно ведётся: в ней фиксируются все выставленные счета-фактуры.

• Проверьте доход за 2025 год и определите, стали ли вы плательщиком НДС автоматически
• Рассчитайте налоговую нагрузку при каждом варианте (освобождение / 5% / 7% / 22%) с учётом структуры ваших поставщиков
• Зафиксируйте методику раздельного учёта в учётной политике до начала применения режима
• Настройте выставление счетов-фактур со всеми обязательными реквизитами по ст. 169 НК РФ
• Сверьте сроки: декларация — до 25-го числа, уплата — до 28-го числа, тремя частями

Типичные ошибки переходного периода и как они обнаруживаются

Не выставлять счета-фактуры, полагая, что «на УСН это необязательно». Обнаруживается при первой камеральной проверке декларации покупателя: он заявляет вычет, а счёта-фактуры от вас нет в книге продаж. АСК НДС-2 фиксирует расхождение в режиме реального времени. Вам приходит требование по ст. 93 НК РФ — объяснить или доначислить.

Выбрать спецставку 5%, не считая долю входящего НДС. Если 60% ваших закупок — у плательщиков НДС со ставкой 22%, отказ от вычетов экономически невыгоден. Но переиграть решение через месяц нельзя: спецставка применяется 12 последовательных кварталов. Единственная возможность — окно отказа в первые 4 налоговых периода по абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ (425-ФЗ от 28.11.2025).

Не вести раздельный учёт при смешанных операциях. Если часть операций освобождена по ст. 149 НК РФ, а часть облагается НДС, и раздельного учёта нет — инспекция снимает вычеты по всем облагаемым операциям. Восстановить их в суде при отсутствии первичного учёта крайне сложно: суды при оценке реальности раздельного учёта смотрят на наличие аналитики в регистрах бухучёта и соответствие первичным документам.

Перепутать порог освобождения и порог применения спецставки. 20 млн рублей — порог освобождения от НДС (п. 1 ст. 145 НК РФ), считается по доходу за предыдущий год. 272,5 млн рублей — лимит для спецставки 5%, считается по доходу за текущий год с учётом дефлятора 1,090. Это разные величины с разной базой расчёта. Путаница приводит к неверному определению режима.

Как работает вычет при стандартной ставке: базовая механика

Если вы выбрали стандартную ставку 22%, входящий НДС от поставщиков принимается к вычету в общем порядке ст. 171–172 НК РФ. Условия стандартные: товары (работы, услуги) приняты к учёту, есть корректный счёт-фактура, операция облагается НДС.

Главное отличие для упрощенца — до перехода на НДС вы могли включать весь входящий НДС в расходы (при УСН «доходы минус расходы»). Теперь НДС идёт в вычет, а не в расходы. Это меняет базу налога по УСН. Бухгалтеру нужно перенастроить аналитику: разделить суммы, которые шли в расходы по УСН, и те, что теперь идут в книгу покупок.

Особый случай — восстановление НДС. Если вы принимали НДС к вычету, а потом начали использовать актив в необлагаемых операциях или перешли на освобождение — НДС подлежит восстановлению по ст. 170 НК РФ. Механика восстановления зависит от вида актива (товар, основное средство, нематериальный актив) — порядок расчёта [VERIFY] применительно к вашей конкретной ситуации.

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Нормы НК РФ и параметры реформы НДС-2026 применяются с учётом индивидуальных обстоятельств — для оценки конкретной ситуации обратитесь к специалисту.