Раздельный учёт НДС на УСН: IT-компания

25 мая 2026 · Автор: Наталья Свияжская

Шаг 1. Проверить: касается ли это вашей IT-компании вообще

Возражение «я на упрощёнке, меня это не касается» с 2025 года больше не работает. Закон 176-ФЗ от 12.07.2024 сделал упрощенцев полноценными плательщиками НДС — если их доход превысил пороговое значение. С 2026 года этот порог установлен на уровне 20 млн рублей за предыдущий календарный год (п. 1 ст. 145 НК РФ в редакции 425-ФЗ от 28.11.2025).

Важный нюанс для IT-компаний в форме ИП: с апреля 2026 года проценты по банковским вкладам не учитываются при определении этого порога — если совокупный доход ИП за 2025 год не превысил 60 млн рублей (104-ФЗ от 25.04.2026). Для организаций это исключение не действует.

Три сценария для IT-компании:

Шаг 2. Классифицировать операции IT-компании по режиму НДС

Раздельный учёт НДС на УСН в IT-компании начинается с чёткого разграничения операций на облагаемые и освобождённые от НДС. Смешивать их в одном потоке — прямой путь к отказу в вычетах и претензиям инспектора.

Освобождены от НДС (ст. 149 НК РФ, пп. 26 п. 2) операции по передаче исключительных прав на программы для ЭВМ и базы данных, включённые в реестр российского программного обеспечения Минцифры России, а также прав на их использование по лицензионным договорам. Льгота распространяется только на ПО из реестра: если продукт в реестр не внесён — льготы нет, НДС начисляется в общем порядке.

Облагаются НДС в IT-компании, как правило:

• разработка ПО на заказ (договор подряда или договор о создании ОИС без передачи исключительных прав);
• техническая поддержка, сопровождение, обновление — если они выделены в отдельный договор и не являются неотъемлемой частью лицензионного соглашения;
• SaaS, облачные сервисы — при предоставлении доступа без передачи прав на ПО (квалификация зависит от структуры договора);
• консультационные услуги, обучение, интеграционные работы;
• передача прав на ПО, не включённое в реестр Минцифры.

Практически важно: один и тот же IT-продукт может одновременно порождать облагаемые и освобождённые операции — например, когда лицензия на ПО из реестра сопровождается платной техподдержкой по отдельному договору. В этом случае необходимо разграничение уже на уровне договорной структуры и первичных документов.

Шаг 3. Выбрать ставку НДС и зафиксировать выбор

IT-компания на УСН, ставшая плательщиком НДС, вправе выбрать между тремя ставками:

• 5% (расчётная 5/105) — если доход не превышает 272,5 млн рублей в год (пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ). Без права на вычет входного НДС.
• 7% (расчётная 7/107) — если доход от 272,5 до 490,5 млн рублей (пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ). Без права на вычет входного НДС.
• 22% (или 10%, 0% — по отдельным операциям) — стандартные ставки ст. 164 НК РФ с правом на вычет входного НДС.

Для большинства IT-компаний на УСН со смешанной выручкой ставка 5% или 7% выгоднее, если входящий НДС невелик (ПО — преимущественно интеллектуальный труд, а не материалоёмкое производство). Однако при значительных закупках оборудования, серверов, лицензий у плательщиков НДС — вычет по ставке 22% может оказаться ощутимым. Расчёт нужен конкретный, под вашу структуру затрат.

Критически важно: выбранная спецставка (5% или 7%) применяется в течение 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ). Отказаться раньше нельзя. Исключение: для компаний, впервые переходящих на спецставку с 2026 года, действует «окно отказа» — 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ). Это единственная возможность выйти из спецставки досрочно — и она одноразовая.

Выбор ставки осуществляется путём первого применения в декларации. Отдельного уведомления в налоговый орган не требуется, но учётная политика должна зафиксировать этот выбор с указанием нормы-основания.

Шаг 4. Настроить раздельный учёт — методика и учётная политика

Раздельный учёт НДС регулируется ст. 170 НК РФ. Обязанность его ведения возникает, когда компания одновременно совершает операции, облагаемые НДС, и операции, освобождённые от него (ст. 149 НК РФ). Без раздельного учёта вся сумма входного НДС к вычету не принимается и в расходы по налогу на прибыль не включается.

Методика раздельного учёта для IT-компании на УСН включает три уровня:

Уровень 1 — прямой учёт входного НДС. Расходы, однозначно относящиеся к облагаемым операциям (например, покупка серверов для проекта на заказ под ставку 22%), — НДС принимается к вычету в полном объёме. Расходы, однозначно относящиеся к освобождённым операциям (например, услуги по регистрации ПО в реестре), — НДС к вычету не принимается, включается в стоимость.

Уровень 2 — пропорциональный метод для общехозяйственных расходов: аренда офиса, связь, бухгалтерские услуги, ПО общего назначения. Пропорция считается по формуле: доля облагаемой выручки в совокупной выручке за квартал. Соответствующая доля входного НДС принимается к вычету; оставшаяся включается в стоимость.

Уровень 3 — учёт в программе. Каждая входящая счёт-фактура должна быть отмечена: «облагаемое», «необлагаемое», «общехозяйственное». Книга покупок формируется с учётом этого разграничения. Без аналитики в учётной системе ручной пересчёт при каждой проверке неизбежен.

«Правило пяти процентов» (п. 4 ст. 170 НК РФ): если доля совокупных расходов на необлагаемые операции не превышает 5% от общей суммы расходов за квартал, входной НДС можно принять к вычету в полном объёме без распределения. Для IT-компаний с небольшой долей лицензионных операций это правило может существенно упростить учёт — но оно требует ежеквартального расчёта и документального подтверждения.

Всё перечисленное должно быть закреплено в учётной политике для целей налогообложения — отдельным разделом о раздельном учёте НДС. Учётная политика принимается до начала налогового периода; внесение изменений в течение года допускается только при изменении законодательства или смене вида деятельности.

Шаг 5. Оформить первичку и счета-фактуры правильно

IT-компания на УСН, ставшая плательщиком НДС, обязана выставлять счета-фактуры по всем облагаемым операциям (ст. 169 НК РФ). Требования к содержанию счёта-фактуры стандартные: наименование, ИНН, дата, номер, ставка, сумма НДС.

По операциям, освобождённым от НДС по ст. 149 НК РФ (передача прав на ПО из реестра Минцифры), счёт-фактура выставляется с отметкой «Без налога (НДС)». Выставлять счёт-фактуру с нулевой ставкой в этом случае — ошибка: нулевая ставка и освобождение от налога — разные правовые конструкции с разными последствиями.

Правила для IT-компании при смешанной выручке:

• Договоры и первичные документы разграничивают облагаемые и освобождённые услуги. Один акт на «разработку и лицензию» без разбивки — риск того, что инспектор квалифицирует всю сумму как облагаемую.
• Книга продаж включает счета-фактуры по облагаемым операциям; книга покупок — по входящим счетам-фактурам от поставщиков в части принимаемого к вычету НДС.
• Раздел 7 декларации по НДС заполняется по операциям, освобождённым от налога. Коды операций для ПО-льготы указаны в приказе ФНС, регулирующем форму декларации. Ошибка в кодах — основание для запроса пояснений.
• При применении спецставок 5% или 7% право на вычет входного НДС не возникает (п. 8 ст. 164 НК РФ): входной НДС включается в стоимость приобретённых товаров, работ, услуг.

Шаг 6. Типичные ошибки IT-компаний при раздельном учёте НДС на УСН

Анализ стандартных ситуаций перехода позволяет выделить несколько повторяющихся ошибок:

Ошибка 1: распространение льготы ст. 149 НК РФ на весь IT-продукт без проверки реестра. Льгота действует только для ПО, включённого в реестр российского программного обеспечения Минцифры. Если продукт не включён или включён после даты реализации — льготы нет. Инспектор проверяет дату включения в реестр.

Ошибка 2: смешение техподдержки с лицензией в одном договоре и одной счёт-фактуре. Налоговый орган при проверке вправе разграничить операции самостоятельно — и не в вашу пользу. Структурировать договоры нужно до начала выставления документов.

Ошибка 3: применение ставки 5% и одновременная попытка принять входной НДС к вычету. При спецставках 5% и 7% право на вычет не возникает (п. 8 ст. 164 НК РФ). Ошибка выявляется автоматически при сопоставлении книги покупок и декларации в системе АСК НДС.

Ошибка 4: отсутствие расчёта пропорции или применение прошлогодней пропорции. Пропорция для распределения общехозяйственного входного НДС считается за каждый квартал. Использование годового или прошлого показателя — методологическая ошибка, которую инспектор укажет в акте проверки.

Ошибка 5: несвоевременная корректировка учётной политики. Политика должна действовать с начала первого квартала применения НДС. Принятие её «задним числом» — риск признания раздельного учёта неведённым, что влечёт доначисление НДС со всей выручки без права на вычет.

• Сравнить доход за предыдущий год с порогом 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ).
• Проверить, включено ли ПО в реестр Минцифры — по каждому продукту и дате.
• Разграничить договоры: лицензия (ст. 149), разработка/поддержка (облагается НДС).
• Выбрать ставку (5% или 7%) с учётом структуры затрат — расчёт по конкретным цифрам.
• Принять учётную политику с разделом о раздельном учёте до начала квартала применения НДС.
• Настроить аналитику в учётной системе: признак каждой операции и каждой входящей счёт-фактуры.

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Налоговое регулирование меняется — уточняйте актуальные нормы по текущей редакции НК РФ или обратитесь за консультацией.