Порог освобождения от НДС: медицина
Медицинская организация на УСН освобождена от НДС, если доход за предыдущий год не превысил 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ в ред. 425-ФЗ от 28.11.2025). Если превысил — нужно выбрать между спецставкой 5% или 7% и стандартной ставкой 22%. При этом большинство собственно медицинских услуг остаются льготными по ст. 149 НК РФ вне зависимости от того, платит ли клиника НДС. Вопрос не в том, избежать ли НДС, а в том, как корректно выстроить учёт и не потерять льготы.
Почему медицинский бизнес на УСН столкнулся с НДС
С 1 января 2025 года все организации и ИП на упрощённой системе налогообложения стали плательщиками НДС — это норма 176-ФЗ от 12.07.2024. До этого упрощенцы НДС не платили автоматически. Теперь ситуация другая: обязанность исчислять и платить НДС возникает по умолчанию, а освобождение — это право, которое нужно подтверждать.
С 1 января 2026 года 425-ФЗ от 28.11.2025 уточнил параметры: основная ставка НДС повышена до 22% (расчётная 22/122), порог освобождения по ст. 145 НК РФ для упрощенцев установлен на уровне 20 млн рублей дохода за предыдущий год. Дефлятор УСН на 2026 год — 1,090 (приказ МЭР от 06.11.2025 № 734), что формирует лимиты спецставок: 272,5 млн рублей для ставки 5% и 490,5 млн рублей для ставки 7% (п. 8–9 ст. 164 НК РФ).
Для медицины это означает следующее: небольшая клиника с выручкой до 20 млн рублей в год вправе вообще не платить НДС. Клиника крупнее — обязана выбрать ставку и правильно разграничить льготные и облагаемые операции. Типичное возражение «меня это не касается, я на упрощёнке» — ошибочное. На упрощёнке можно быть и плательщиком НДС одновременно. Это стандартная ситуация с 2025 года.
Две разные льготы: ст. 145 и ст. 149 — не путать
В медицинской отрасли действуют сразу два механизма освобождения от НДС, и их важно разграничивать: они работают по разным основаниям, имеют разные условия и разные последствия при нарушении.
Статья 145 НК РФ — освобождение от обязанностей плательщика НДС. Распространяется на организацию в целом. Условие: доход за предыдущий год — не более 20 млн рублей. Освобождение требует уведомления, длится 12 последовательных месяцев и продлевается при сохранении условий. Применяется к любым операциям организации, кроме ввоза товаров и ряда агентских операций.
Статья 149 НК РФ — льгота по видам операций. Распространяется на конкретные услуги из закрытого перечня, независимо от режима налогообложения и дохода. Медицинские услуги, оказываемые медицинскими организациями и ИП, при наличии лицензии — в пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ. Льгота применяется автоматически по факту соответствия перечню; отказаться от неё нельзя.
Практический вывод: если клиника с выручкой 35 млн рублей в год не может применять ст. 145 (превышен порог 20 млн руб.), то её медицинские услуги из перечня ст. 149 всё равно не облагаются НДС. НДС возникает только по тем операциям, которые не входят в льготный перечень: продажа медоборудования, аренда помещений, консультационные услуги без лицензии, косметология (некоторые виды).
Пошаговая инструкция: определить свой режим НДС в медицине
Ниже — последовательность действий для медицинской организации на УСН, которая разбирается со своим статусом по НДС с 2026 года. Каждый шаг содержит конкретное действие и критерий принятия решения.
Шаг 1. Определить доход за предыдущий год
Берётся совокупный доход за предыдущий календарный год по правилам гл. 26.2 НК РФ. Для ИП с 2026 года в пороге не учитываются проценты по банковским вкладам, если доход не превышает 60 млн рублей за 2025 год (104-ФЗ от 25.04.2026). Если доход за предыдущий год не превысил 20 млн рублей — вы вправе применить освобождение по ст. 145 НК РФ. Если превысил — переходите к шагу 3.
Шаг 2. Подать уведомление об освобождении (если порог соблюдён)
Уведомление подаётся в налоговый орган не позднее 20-го числа месяца, с которого планируется применять освобождение. К уведомлению прилагаются выписки из книги учёта доходов и расходов или бухгалтерских регистров, подтверждающие размер дохода. Форма уведомления — по приказу ФНС [VERIFY]. После подачи уведомления организация не исчисляет НДС, не сдаёт декларацию по НДС (кроме случаев агентского НДС и ввоза) и не выставляет счета-фактуры с НДС.
Важно: если в течение периода освобождения доход превысит 20 млн рублей, освобождение утрачивается с первого числа месяца, в котором произошло превышение. С этого же момента нужно начислять НДС и сдавать декларацию.
Шаг 3. Выбрать ставку НДС (если порог превышен)
Если доход за предыдущий год превысил 20 млн рублей, организация обязана платить НДС. Доступны три варианта:
- Спецставка 5% (расчётная 5/105) — при доходе до 272,5 млн рублей (лимит 2026 с дефлятором 1,090). Вычеты по ст. 171–172 НК РФ не применяются. Ставка связывает на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ).
- Спецставка 7% (расчётная 7/107) — при доходе до 490,5 млн рублей. Условия те же: без вычетов, 12 кварталов. Для клиник с существенными закупками медоборудования невыгодна — входной НДС не возмещается.
- Стандартная ставка 22% (расчётная 22/122) — с правом на вычеты по всем облагаемым операциям. Выгодна, если доля входного НДС (поставщики, оборудование, ремонт) велика относительно выручки по облагаемым операциям.
Для медицинских организаций, у которых основная выручка — льготные услуги по ст. 149, а облагаемые операции минимальны, спецставка 5% часто экономически предпочтительнее. Но здесь нет универсального ответа: нужно считать по конкретной структуре затрат.
Структура доходов клиники определяет, какой режим выгоднее. Неверный выбор ставки фиксируется на 12 кварталов (3 года) без права пересмотра в стандартном порядке. Если вы ещё не выбрали ставку или сомневаетесь в правильности сделанного выбора — разберём ситуацию до того, как она станет необратимой.
Разобрать ситуациюШаг 4. Организовать раздельный учёт
Если организация одновременно ведёт льготные операции (ст. 149) и облагаемые НДС, обязателен раздельный учёт по п. 4 ст. 170 НК РФ. Это означает отдельный учёт выручки, затрат и входного НДС по каждой группе операций. При нарушении правил раздельного учёта налоговый орган вправе отказать в вычетах по всем операциям или доначислить НДС по льготным.
Практический минимум для клиники: выделить счета учёта по видам услуг в разрезе льготных/нельготных, настроить учётную политику с описанием методики распределения входного НДС, хранить первичные документы раздельно по видам деятельности.
Шаг 5. Проверить лицензию
Льгота по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ применяется только при наличии действующей медицинской лицензии. Если лицензия истекла или переоформляется — в этот период льгота не применяется и с выручки нужно начислять НДС. Суды в подобных ситуациях, как правило, оценивают наличие лицензии именно в момент оказания услуги, а не на дату выставления счёта. Отслеживать сроки — задача не бухгалтера, а руководителя.
Шаг 6. Уведомить контрагентов
Если организация переходит с режима освобождения на уплату НДС или меняет ставку, это влияет на договорные цены. Проверьте условия действующих договоров: если цена указана «без НДС» или «НДС не предусмотрен», при смене режима НДС фактически «садится» внутрь цены, сокращая выручку. В новых договорах и допсоглашениях прямо указывайте ставку и сумму НДС.
Три сценария для медицинской организации на УСН
- Сценарий 1. Небольшая частная клиника, доход за 2025 год — 14 млн рублей
-
Доход не превышает 20 млн рублей. Клиника вправе применить освобождение по п. 1 ст. 145 НК РФ. Нужно подать уведомление до 20-го числа первого месяца применения. Декларация по НДС не сдаётся, счета-фактуры с НДС не выставляются. Льгота по ст. 149 продолжает действовать параллельно — по медицинским услугам из перечня.
Риск: превышение 20 млн в течение года означает немедленную утрату освобождения. Отслеживать нарастающим итогом ежемесячно. - Сценарий 2. Многопрофильный медицинский центр, доход за 2025 год — 180 млн рублей, из них льготные услуги по ст. 149 — 90%, прочие (косметология, аренда оборудования) — 10%
-
Порог 20 млн превышен — освобождение по ст. 145 недоступно. Доход вписывается в лимит 272,5 млн рублей для ставки 5%. Медицинские услуги из перечня ст. 149 по-прежнему не облагаются НДС. НДС начисляется только с 10% выручки — с нельготных операций. Вычеты при ставке 5% недоступны. Спецставка фиксируется на 12 кварталов.
Что делать: настроить раздельный учёт, пересмотреть договоры по нельготным услугам, проверить лицензию. - Сценарий 3. Сеть клиник, доход за 2025 год — 400 млн рублей, значительные закупки медоборудования с НДС
-
Лимит ставки 5% (272,5 млн руб.) превышен. Доступны: ставка 7% без вычетов или стандартная ставка 22% с вычетами. При высокой доле входного НДС (оборудование, расходные материалы от плательщиков НДС) стандартная ставка 22% может быть экономически выгоднее, чем 7% без права на вычет. Расчёт нужно делать по фактическим данным закупок.
Что делать: построить финансовую модель до выбора ставки. Окно однократного отказа от ставки — 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ по 425-ФЗ).
Типичные ошибки при переходе: как не создать проблему из некритичной ситуации
Ошибка 1: Игнорировать уведомление об освобождении. Многие небольшие клиники просто не подали уведомление по ст. 145 НК РФ, считая, что «на упрощёнке НДС нет». Это ошибка: без уведомления освобождение не действует. Налоговый орган вправе доначислить НДС за весь период отсутствия уведомления. Сроки подачи уведомления нужно отслеживать заранее.
Ошибка 2: Смешать льготы ст. 145 и ст. 149 в одну. Льгота ст. 149 — по видам услуг. Льгота ст. 145 — по статусу организации. Это разные инструменты. Медицинские услуги из перечня не облагаются НДС даже у плательщика НДС. При этом прочие услуги клиники — облагаются в общем порядке. Путаница ведёт к занижению базы или, наоборот, к ненужному начислению НДС с льготных операций.
Ошибка 3: Не проверить лицензию перед применением льготы. Лицензия — обязательное условие льготы по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ. Без лицензии услуга облагается НДС. Суды при проверках первым делом запрашивают документы, подтверждающие лицензию именно в период оказания услуг.
Ошибка 4: Выбрать спецставку не считая входного НДС. Спецставка 5% на первый взгляд выглядит привлекательно. Но при значительных закупках расходных материалов, оборудования и фармпрепаратов от плательщиков НДС отсутствие вычетов делает её невыгодной. Решение принимается на калькуляторе, не интуитивно.
Ошибка 5: Не обновить договоры при смене режима. Если договор заключён с формулировкой «НДС не облагается» или «без НДС», а организация стала плательщиком НДС, возникает риск: НДС нужно начислить, а предъявить его контрагенту по старому договору сложнее. Ретроактивное изменение ценообразования — источник споров с контрагентами.
- Рассчитать совокупный доход за предыдущий год и сравнить с порогом 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ)
- Подать уведомление об освобождении или о выбранной ставке в налоговый орган в установленный срок
- Проверить действие медицинской лицензии и сроки её переоформления
- Настроить раздельный учёт льготных (ст. 149) и облагаемых операций по п. 4 ст. 170 НК РФ
- Привести договоры с контрагентами в соответствие с новым режимом НДС
Из практики: клиника потеряла освобождение из-за одного квартала
Небольшой стоматологический центр на УСН в начале 2026 года применял освобождение по ст. 145 НК РФ: доход за 2025 год составил 18,7 млн рублей. В третьем квартале 2026 года центр провёл масштабную рекламную кампанию и в сентябре нарастающий доход превысил 20 млн рублей. Освобождение автоматически утратилось с 1 сентября 2026 года. Декларация за третий квартал подана с НДС. Но за июль и август НДС не начислялся и счета-фактуры не выставлялись.
По результату камеральной проверки налоговый орган доначислил НДС за июль–август, начислил пени и штраф 20% (п. 1 ст. 122 НК РФ) за неуплату по неосторожности. Итог — дополнительные потери плюс административные расходы на урегулирование. Ситуация типична и полностью предотвратима при ежемесячном мониторинге дохода и правильном учёте порогового квартала.
Кейс обезличен, суммы иллюстративны.
Окно отказа от спецставки: что это и когда работает
425-ФЗ от 28.11.2025 ввёл особый механизм — окно однократного отказа от спецставки (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ). Для организаций, впервые перешедших на спецставку с 2026 года, предусмотрено право однократно отказаться от неё в течение 4 налоговых периодов (кварталов) с начала применения. После использования этого права отказаться досрочно уже нельзя — ставка фиксируется на оставшиеся из 12 кварталов периоды.
Для медицинских организаций это важно: если в первые несколько кварталов выяснится, что выбранная спецставка невыгодна (например, выросли закупки оборудования с НДС и вычеты стали значимыми), есть шанс пересмотреть решение. Упускать это окно не следует — следующей возможности не будет.
Окно отказа от спецставки — разовое. Если вы применяете спецставку с начала 2026 года, у вас есть ограниченное число кварталов, чтобы оценить её эффективность и, при необходимости, сменить режим. После закрытия окна — только досидеть до конца 12-квартального периода. Разобрать, выгодна ли ваша текущая ставка, можно сейчас.
Получить консультациюКак снять возражение «меня это не касается, я на упрощёнке»
Это самое распространённое заблуждение среди медицинских предпринимателей на УСН в 2026 году. С 2025 года упрощёнка и НДС — не взаимоисключающие понятия. Организация может одновременно применять УСН и быть плательщиком НДС.
Освобождение по ст. 145 — это право, которое нужно подтверждать уведомлением и соблюдением порогового условия в 20 млн рублей дохода. Если уведомление не подано или порог превышен — НДС начисляется в общем порядке, независимо от того, знает об этом организация или нет. Незнание не освобождает от доначислений.
При этом медицинская специфика не отменяет общее правило, а дополняет его: льгота ст. 149 сохраняется, но только для услуг из перечня и только при наличии лицензии. Прочие операции клиники — под НДС.
Часто задаваемые вопросы
1. Кто из упрощенцев платит НДС в 2026 году?
Упрощенцы с доходом за предыдущий год свыше 20 млн рублей обязаны платить НДС с 2026 года согласно 176-ФЗ от 12.07.2024 и 425-ФЗ от 28.11.2025. Те, чей доход не превысил 20 млн рублей, вправе применять освобождение по п. 1 ст. 145 НК РФ. Для применения освобождения необходимо подать уведомление в налоговый орган.
2. Что меняется по НДС с 2026 года?
С 1 января 2026 года вступил в силу 425-ФЗ от 28.11.2025: основная ставка НДС повышена с 20% до 22% (п. 3 ст. 164 НК РФ), порог освобождения УСН от НДС установлен на уровне 20 млн рублей дохода за предыдущий год, введено окно однократного отказа от спецставки (4 налоговых периода по абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ). Лимиты спецставок с учётом дефлятора 1,090: 272,5 млн рублей для 5% и 490,5 млн рублей для 7%.
3. Как уведомить об освобождении от НДС?
Уведомление подаётся в налоговый орган до 20-го числа месяца, с которого планируется применять освобождение. К нему прилагаются выписки из книги учёта доходов и расходов или регистров бухгалтерского учёта, подтверждающие, что доход за предыдущий год не превысил 20 млн рублей. Форма уведомления — по приказу ФНС [VERIFY].
4. Можно ли применять вычеты при пониженной ставке?
При выборе спецставки 5% или 7% право на вычеты по ст. 171–172 НК РФ не применяется. Вычеты доступны только при работе на стандартной ставке 22% (или 10% для льготных категорий товаров). Для медицинских организаций с высокой долей закупок от плательщиков НДС это ключевой критерий выбора ставки — стандартная ставка может оказаться выгоднее.
5. Как перейти на НДС без ошибок?
Необходимо: определить доход за предыдущий год и выбрать режим (освобождение или спецставку); подать уведомление в срок; организовать раздельный учёт льготных (ст. 149) и облагаемых операций; проверить действие медицинской лицензии. Спецставка 5% связывает организацию на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ) — отказаться досрочно можно только в окно 4 периодов (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ).
Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Параметры законодательства (ставки, пороги, сроки) актуальны на дату публикации. Перед принятием решений рекомендуем проверить текущую редакцию нормативных актов.