Переход на НДС в 2026: медицина — что учесть

Виктор Аршинов · 28 апреля 2026

Почему это касается вас, даже если вы на упрощёнке

Самое распространённое заблуждение — «я на УСН, значит, НДС не плачу». До 2025 года это было так. С принятием 176-ФЗ от 12.07.2024 упрощенцы стали полноправными плательщиками НДС. С 2026 года реформу дополнил 425-ФЗ от 28.11.2025: основная ставка выросла до 22% (п. 3 ст. 164 НК РФ), порог освобождения для УСН зафиксирован на уровне 20 млн рублей дохода за предыдущий год (п. 1 ст. 145 НК РФ).

Для медицинского бизнеса это означает следующее: если ваша клиника, стоматология, лаборатория или центр реабилитации на УСН заработала в 2025 году более 20 млн рублей — с 1 января 2026 года вы обязаны либо исчислять НДС, либо подтвердить право на освобождение. Отсутствие действий — это тоже выбор, но очень дорогой: штраф за неуплату по п. 1 ст. 122 НК РФ составляет 20% от суммы недоимки, а при умысле — 40% (п. 3 ст. 122 НК РФ).

Порог 20 млн рублей по действующей редакции заморожен на несколько лет (законопроект N 1256655-8, закон лета 2026 года). Конкретные годы дальнейшего снижения уточняйте по текущей редакции НК РФ [VERIFY]. На 2026–2028 годы ориентир — 20 млн рублей.

Шаг 1. Определить, кто вы: плательщик НДС или освобождённый

Первый вопрос — сколько составил ваш доход за 2025 год. Это не выручка по кассе, а доход, учитываемый при определении объекта налогообложения по УСН. Важный нюанс для ИП: согласно 104-ФЗ от 25.04.2026, проценты по банковским вкладам не учитываются при сравнении с порогом 20 млн рублей — если совокупный доход ИП за 2025 год без учёта процентов не превысил 60 млн рублей.

Алгоритм простой:

• Доход за 2025 год не превысил 20 млн рублей — вы вправе применять освобождение от НДС по п. 1 ст. 145 НК РФ. Нужно подать уведомление (шаг 4).
• Доход превысил 20 млн рублей, но не превышает 272,5 млн рублей — можно выбрать спецставку 5% (пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ). Без права на вычеты.
• Доход превысил 272,5 млн рублей, но не превышает 490,5 млн рублей — спецставка 7% (пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ). Без права на вычеты.
• Доход превысил 490,5 млн рублей — стандартный режим, ставка 22%, вычеты доступны (ст. 171–172 НК РФ). Оставаться на УСН при этом уже нельзя (лимит сохранения УСН в 2026 году — 490,5 млн рублей).

Лимиты 272,5 и 490,5 млн рублей рассчитаны с учётом дефлятора 1,090 (приказ МЭР от 06.11.2025 N 734) применительно к п. 8–9 ст. 164 НК РФ.

Шаг 2. Проверить льготу по ст. 149 НК РФ — это главное для медицины

Здесь кроется ключевая особенность отрасли. Статья 149 НК РФ освобождает от НДС ряд медицинских операций — и это освобождение не зависит от того, на каком режиме работает клиника. Оно применяется наравне с освобождением по ст. 145 и принципиально от него отличается: ст. 145 — это освобождение налогоплательщика по размеру выручки, ст. 149 — освобождение конкретных операций.

Что освобождено от НДС по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ применительно к медицине:

• Медицинские услуги, оказываемые медицинскими организациями и ИП, осуществляющими медицинскую деятельность, — по перечню, установленному Правительством РФ (Постановление Правительства РФ N 132 [VERIFY] — уточните актуальный перечень). Сюда входят: диагностика, профилактика, лечение, медицинская реабилитация.
• Медицинские услуги скорой помощи населению.
• Услуги по дежурству медицинского персонала у постели больного.
• Патолого-анатомические услуги.
• Услуги, оказываемые беременным женщинам, новорождённым, инвалидам и наркологическим больным (в рамках медицинской деятельности).

Что, как правило, под льготу не попадает: косметологические услуги эстетической направленности (не являющиеся медицинскими), санаторно-оздоровительные услуги (в зависимости от лицензии), продажа лекарств и медизделий (отдельный режим налогообложения — ставка 10% по п. 2 ст. 164 НК РФ для ряда позиций). Точная квалификация зависит от лицензии, формулировки договора и характера услуги.

Практически важно: если у вас смешанная деятельность — часть услуг льготная, часть облагаемая — вам обязателен раздельный учёт по ст. 170 НК РФ. Без него входной НДС по общехозяйственным расходам вы не сможете ни принять к вычету, ни обоснованно включить в затраты.

Шаг 3. Выбрать ставку — 5%, 7% или 22%

Если после анализа по ст. 149 выясняется, что часть ваших услуг облагается НДС — нужно выбрать ставку. Это не просто арифметика: выбор ставки фиксируется на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ). Поменять его досрочно нельзя. Для тех, кто впервые стал плательщиком НДС с 2026 года по 176-ФЗ, действует окно однократного отказа от спецставки — 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ). Что это означает на практике: если вы выбрали 5% и поняли, что выгоднее работать на 22% с вычетами — есть ограниченное окно для пересмотра.

Для большинства медицинских организаций, у которых облагаемая часть деятельности невелика, а входной НДС от поставщиков минимален (расходные материалы, оборудование), выбор ставки 5% или 7% часто оказывается выгоднее. Но есть нюанс: при спецставке вы не принимаете входной НДС к вычету — он включается в стоимость расходов. При ставке 22% вычеты доступны, но сама ставка выше, и вычитать вы сможете только НДС от плательщиков на ОСНО, которые выставляют счета-фактуры.

Расчёт «что выгоднее» зависит от:

• Доли входного НДС в структуре расходов.
• Доли облагаемых услуг в общей выручке.
• Того, являются ли ваши ключевые поставщики плательщиками НДС.
• Ценовой чувствительности ваших пациентов (физические лица НДС к вычету не принимают — для них важна итоговая цена).

Шаг 4. Подать уведомление об освобождении или зафиксировать выбор ставки

Два разных документа — две разных ситуации.

Освобождение по ст. 145 НК РФ (доход за 2025 год не превысил 20 млн рублей). Уведомление подаётся в налоговый орган не позднее 20-го числа месяца, с которого применяется освобождение (п. 3 ст. 145 НК РФ). К уведомлению прикладываются документы, подтверждающие размер выручки. Форма уведомления — установлена ФНС [VERIFY]. Важно: освобождение по ст. 145 НК РФ не распространяется на операции по ввозу товаров и не снимает обязанности выставлять документы с пометкой «Без НДС».

Выбор спецставки 5% или 7% (ст. 164 НК РФ). Здесь отдельного уведомления не предусмотрено: выбор ставки отражается в первой декларации по НДС за период применения. Фактически это означает, что уже в декларации за I квартал 2026 года нужно корректно указать ставку и применять её далее на протяжении 12 кварталов.

Освобождение по ст. 149 НК РФ носит обязательный характер для перечисленных операций — отказаться от него, в отличие от ряда других льгот по ст. 149, нельзя применительно к медицинским услугам пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ. Никакого уведомления не требуется, но необходимо иметь лицензию на медицинскую деятельность и документально подтверждать характер услуг.

• Подсчитан доход за 2025 год, определён статус: плательщик НДС или освобождённый по ст. 145.
• Проведена ревизия услуг на соответствие перечню пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ, проверена лицензия.
• Выбрана ставка для облагаемых операций (5%, 7% или 22%), просчитана экономика.
• Подано уведомление об освобождении по ст. 145 (если применимо) или ставка зафиксирована в первой декларации.
• Настроен раздельный учёт, шаблоны счетов-фактур и договоров с пациентами и контрагентами.

Шаг 5. Настроить учёт, счета-фактуры и раздельный учёт

Переход на НДС — это не только вопрос ставки. Это перестройка операционного учёта. Для медицинских организаций типичны три уязвимости.

Уязвимость 1: Договоры с пациентами без указания НДС. Если в договоре прописана цена без пометки об НДС, а вы теперь обязаны его исчислять — возникает вопрос: НДС включён в цену (расчётная ставка) или начисляется сверх неё? Для физических лиц начислить НДС сверх цены договора фактически невозможно. Нужно переработать шаблоны договоров и прайс-листы.

Уязвимость 2: Отсутствие раздельного учёта при смешанной деятельности. Если у вас одновременно есть льготные операции по ст. 149 и облагаемые — без раздельного учёта вы не вправе принять к вычету входной НДС по общехозяйственным расходам (аренда, коммунальные услуги, административный персонал). Механизм раздельного учёта устанавливается учётной политикой (ст. 170 НК РФ). «Правило 5%» — когда весь входной НДС можно принять к вычету, если доля необлагаемых операций не превышает 5% — при пониженных ставках 5/7% не применяется: вычеты по этим ставкам полностью запрещены.

Уязвимость 3: Счета-фактуры. Для облагаемых операций счёт-фактура обязателен по ст. 169 НК РФ. Для освобождённых по ст. 149 — счёт-фактура не выставляется либо выставляется с пометкой «Без НДС». Для физических лиц (розничная торговля услугами) счёт-фактура может быть заменён кассовым чеком с соответствующими реквизитами — уточните порядок по действующим разъяснениям ФНС [VERIFY].

Шаг 6. Декларация, уплата и первые контрольные точки

Декларация по НДС подаётся электронно не позднее 25-го числа месяца, следующего за отчётным кварталом (п. 5 ст. 174 НК РФ). Уплата — тремя равными частями, до 28-го числа каждого из трёх месяцев следующего квартала (п. 1 ст. 174 НК РФ).

Для переходящих впервые: не забудьте про вводные разделы декларации, в которых отражаются освобождённые операции по ст. 149. Даже если вы не платите НДС с этих операций — они должны быть в декларации. Отсутствие сведений об освобождённых операциях — распространённая ошибка при первой сдаче.

Если в 2026 году ваш доход превысит порог, открывающий следующую ставку (272,5 млн рублей для перехода с 5% на 7%, 490,5 млн рублей для выхода с УСН), — смена ставки происходит с квартала, в котором превышение зафиксировано. Для выхода за лимит УСН — с начала квартала превышения, не с начала года.

Хранить документы, подтверждающие право на льготу по ст. 149 (лицензию, договоры, первичку), нужно не менее срока, по истечении которого налоговый орган утрачивает право назначить проверку. Этот срок уточните по действующей редакции ст. 89 НК РФ [VERIFY].

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Применение норм НК РФ зависит от конкретных обстоятельств. Числа, отмеченные [VERIFY], требуют проверки по действующей редакции нормативных актов.