Переход на НДС в 2026: фармацевтика — что учесть

Виктор Аршинов, эксперт по НДС и косвенному налогообложению — 24 апреля 2026

Почему реформа касается фармацевтики на УСН

Самое частое возражение, которое мы слышим от аптек и небольших фармдистрибьюторов: «Я на упрощёнке — НДС меня не касается». До 2025 года так и было. Теперь — нет.

176-ФЗ от 12.07.2024 прямо установил: с 2025 года упрощенцы признаются плательщиками НДС. 425-ФЗ от 28.11.2025 уточнил параметры с 01.01.2026: базовая ставка — 22% (расчётная 22/122, п. 3 ст. 164 НК РФ), порог освобождения для УСН — доход за предыдущий год не более 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ). Если доход в 2025 году превысил 20 млн рублей, освобождение в 2026 году вам недоступно: нужно выбирать режим налогообложения НДС.

Для фармацевтики это означает конкретную управленческую задачу: разобраться со структурой своего ассортимента, определить, какие позиции облагаются по льготной ставке 10%, а какие — по общей, выбрать между спецставками (5% или 7%) или стандартным режимом с правом вычетов. Каждое решение имеет долгосрочные последствия — спецставку нельзя поменять в течение 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ).

Освобождение от НДС по ст. 145: кто имеет право в фармацевтике

Порог освобождения с 01.01.2026 — доход за предыдущий год не более 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ в редакции 176-ФЗ и 425-ФЗ). Если ваша аптека или фармдистрибьютор заработали в 2025 году 19,8 млн рублей — освобождение доступно: НДС не платите, счета-фактуры не выставляете, декларацию не сдаёте.

Важный нюанс, введённый 104-ФЗ от 25.04.2026: для индивидуальных предпринимателей проценты по банковским вкладам не учитываются в пороге при условии, что доход не превысил 60 млн рублей за 2025 год. Если вы аптека в форме ИП и значительную часть дохода составляют проценты по депозитам — это прямо влияет на право применять освобождение. Уточните расчёт с учётом своей структуры доходов.

Освобождение носит уведомительный характер: нужно подать уведомление в налоговый орган. Форму и конкретный срок подачи уточните в действующем регламенте ФНС [VERIFY]. Если уведомление не подано вовремя, налоговый орган вправе считать, что освобождение не применяется, и доначислить НДС.

Порог 20 млн рублей заморожен на уровне 2026 года на несколько лет в связи с принятием закона лета 2026 (законопроект 1256655-8). Точные годы дальнейшего возможного снижения порога уточняются [VERIFY].

Ставки НДС для фармацевтики: 10%, 22%, 5% или 7%

Фармацевтика — одна из немногих отраслей, где НДС по умолчанию не означает ставку 22%. Льготная ставка 10% (расчётная 10/110, п. 2 ст. 164 НК РФ) распространяется на лекарственные препараты, включённые в государственный реестр, медицинские изделия и ряд других позиций. Нулевая ставка 0% действует для ряда экспортных операций (ст. 164 НК РФ).

Однако ассортимент типичной аптеки или дистрибьютора редко однородный. Биологически активные добавки, косметика и гигиенические средства, не включённые в льготный перечень, облагаются по ставке 22%. Смешанный ассортимент означает раздельный учёт (ст. 170 НК РФ) — это дополнительная нагрузка на бухгалтерию.

Теперь о спецставках для упрощенцев. С 2025 года (176-ФЗ) действуют два варианта:

• 5% (расчётная 5/105, пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ) — если доход не превышает 272,5 млн рублей в год (с учётом дефлятора 1,090 на 2026, приказ МЭР от 06.11.2025 №734). Вычеты входящего НДС не применяются.
• 7% (расчётная 7/107, пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ) — если доход до 490,5 млн рублей в год (с тем же дефлятором). Вычеты входящего НДС также не применяются.

Спецставки удобны для аптек с небольшой долей входящего НДС — например, если основные поставщики также на УСН или часть товара ввозится по схемам без НДС. Но если поставщики — крупные фармдистрибьюторы на ОСНО и они выставляют счета-фактуры с НДС, то стандартные ставки 10%/22% с правом вычетов могут оказаться выгоднее.

Ключевое ограничение: выбранный вариант спецставки фиксируется на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ). Если применять спецставку 5%, а через год захотеть перейти на стандартный режим с вычетами — нельзя. Окно для первоначального отказа от спецставки: 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ).

Практика: как фармацевтические упрощенцы встречают реформу

Разберём три типовых ситуации на конкретных сценариях.

Льготы по ст. 149 НК РФ и их взаимодействие с НДС-режимом

Помимо пониженной ставки 10%, фармацевтика может использовать освобождение отдельных операций от НДС по ст. 149 НК РФ. Это касается, в частности, реализации ряда медицинских услуг. Для розничной аптеки или дистрибьютора это, как правило, не основная история — но нужно проверить, не попадает ли часть услуг (например, измерение давления, вакцинация на базе аптеки) под льготу ст. 149.

Если часть операций освобождена по ст. 149, а другая часть облагается НДС, возникает раздельный учёт (ст. 170 НК РФ). Это обязательное требование: распределять входящий НДС между облагаемыми и необлагаемыми операциями. Суды при оценке правомерности вычетов смотрят на наличие реально выстроенного раздельного учёта — отсутствие методики его ведения само по себе создаёт риск отказа в вычетах.

Льгота по ст. 149 — не обязанность, а право. От неё можно отказаться по отдельным операциям (ст. 149 НК РФ), если это выгоднее из-за структуры вычетов. Решение об отказе — также на расчёте, а не по умолчанию.

Типичные ошибки фармацевтических компаний при переходе

По наблюдениям из практики, наиболее частые ошибки при переходе на НДС в фармацевтике:

• Не проверили состав ассортимента. Часть позиций — не лекарства, а БАД или косметика. Реализовывать их по ставке 10% нельзя — только 22%. Занижение ставки — основание для доначисления плюс штраф 20% по п. 1 ст. 122 НК РФ (или 40% при умысле по п. 3 ст. 122).
• Выбрали спецставку не считая. При высокой доле входящего НДС от ОСНО-поставщиков спецставка без вычетов может обходиться дороже. Ошибка закрепляется на 12 кварталов.
• Не подали уведомление об освобождении. Освобождение по ст. 145 работает только при подаче уведомления. Без него — обязанность платить НДС и риск доначислений за весь период.
• Не выстроили раздельный учёт. Если есть операции по 10% и 22%, а также льготные по ст. 149 — без раздельного учёта вычеты налоговый орган снимет.
• Не проверили статус поставщиков. Если поставщик оказался «технической компанией» в понимании ст. 54.1 НК РФ, вычеты по его счетам-фактурам могут быть оспорены. В фармацевтике — отрасли с жёстким контролем лицензий — это встречается реже, но не исключено.

Пошаговый план для фармацевтического бизнеса на УСН

Ниже — конкретные шаги в логической последовательности. Это не исчерпывающий список для всех ситуаций, но рабочая основа для большинства аптек и небольших дистрибьюторов.

1. Определите доход за 2025 год. Если не превысил 20 млн рублей — анализируйте право на освобождение. Если ИП — уточните учёт процентов по вкладам (104-ФЗ). Если превысил — переходите к выбору ставки.
2. Проверьте ассортимент на состав ставок. Какая доля реализации облагается по 10% (лекарства из реестра), какая по 22% (БАД, косметика, нелекарственный ассортимент), есть ли льготные по ст. 149 операции.
3. Рассчитайте налоговую нагрузку по трём сценариям. Спецставка 5% без вычетов vs спецставка 7% vs стандартный режим 10%/22% с вычетами. Входные данные: фактические закупки и структура поставщиков (ОСНО/УСН).
4. Примите решение до начала периода. Выбор ставки фиксируется. Если выбираете спецставку — помните об окне отказа: 4 налоговых периода с момента первого применения (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ).
5. Выстройте раздельный учёт. Утвердите методику распределения входящего НДС между облагаемыми и необлагаемыми операциями приказом по учётной политике.
6. Настройте выставление счетов-фактур. Если работаете на стандартной ставке или 7% — счета-фактуры обязательны по ст. 169 НК РФ. Проверьте учётную систему.
7. Следите за доходом внутри года. Превышение лимита для спецставки или лимита УСН 490,5 млн рублей требует перехода на следующую ставку или на ОСНО. Контролируйте ежеквартально.

• Рассчитан доход за 2025 год — определено право на освобождение или режим НДС
• Проверен ассортимент: какие позиции по 10%, какие по 22%, что под ст. 149
• Сделан расчёт налоговой нагрузки по всем вариантам ставок с учётом входящего НДС
• Принято решение о ставке; при необходимости подано уведомление об освобождении
• Утверждена методика раздельного учёта в учётной политике

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Приведённые данные актуальны по состоянию на дату публикации; перед принятием решений рекомендуется уточнить действующую редакцию нормативных актов.