Переход на НДС при УСН: медицина
· Виктор Аршинов, эксперт по НДС
Медицинская организация на УСН с доходом за 2025 год свыше 20 млн ₽ с 1 января 2026 года обязана платить НДС — это прямое требование 176-ФЗ от 12.07.2024 и 425-ФЗ от 28.11.2025. Большинство медицинских услуг освобождено от НДС по пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ, поэтому для многих клиник переход означает не реальную уплату налога, а выстраивание учёта и документооборота. Ниже — пошаговый порядок для медицинского бизнеса на УСН.
Кого это касается: порог 20 млн ₽ и реформа УСН
Распространённое заблуждение — «я на упрощёнке, НДС не плачу». С 1 января 2025 года это не так. По 176-ФЗ от 12.07.2024 все плательщики УСН признаны плательщиками НДС. Единственный способ легально не платить НДС — применять освобождение.
Для освобождения по ст. 145 НК РФ (в редакции 425-ФЗ от 28.11.2025) доход за предшествующий календарный год не должен превышать 20 млн ₽. Это значение подтверждено п. 1 ст. 145 НК РФ и актуально на 2026 год. Порог заморожен на несколько лет; конкретные годы дальнейшего снижения уточняются [VERIFY].
Важный нюанс для ИП: по 104-ФЗ от 25.04.2026 проценты по банковским вкладам не включаются в расчёт порога 20 млн ₽ — для ИП с доходом не более 60 млн ₽ за 2025 год. Если вы ИП и в прошлом году получили значительный процентный доход по депозитам, он не сдвинет вас за порог.
Дефлятор УСН на 2026 год составляет 1,090 (приказ МЭР от 06.11.2025 № 734). С его учётом лимит доходов для применения ставки 5% — 272,5 млн ₽, для ставки 7% и для сохранения права на УСН — 490,5 млн ₽.
Главный инструмент для медицины: льгота ст. 149 НК РФ
Для большинства медицинских организаций ключевая норма — не порог освобождения, а пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ. Она освобождает от НДС медицинские услуги, оказываемые медицинскими организациями и индивидуальными предпринимателями в соответствии с перечнем, утверждённым Правительством РФ.
Что входит в льготный перечень: медицинские услуги по диагностике, профилактике и лечению, скорая медицинская помощь, услуги по сбору крови, дежурство медицинского персонала, патолого-анатомические услуги, медицинская экспертиза и ряд других видов деятельности. Действие льготы привязано к наличию лицензии на медицинскую деятельность.
Что не подпадает под льготу и облагается НДС: косметические (немедицинские) процедуры, услуги санаторно-курортного характера без медицинской составляющей, продажа товаров (медикаментов, изделий медицинского назначения) в отдельных случаях. Для этих операций придётся исчислять НДС по соответствующей ставке.
Льгота по ст. 149 НК РФ — не то же самое, что освобождение по ст. 145. Ст. 149 применяется к конкретным операциям вне зависимости от размера выручки. Если ваш доход превышает 20 млн ₽, вы всё равно применяете ст. 149 к льготным операциям, но при этом являетесь плательщиком НДС и обязаны вести раздельный учёт.
Пошаговая инструкция для медицинского бизнеса на УСН
Шаг 1. Проверьте порог доходов за предыдущий год
Сложите все доходы по УСН за предшествующий календарный год. Сравните с порогом 20 млн ₽. Если доход не превысил 20 млн ₽ — вы вправе применять освобождение по ст. 145 НК РФ. Если превысил — вы плательщик НДС и переходите к шагу 3.
Для ИП в медицине: если доход за 2025 год не превысил 60 млн ₽, проценты по банковским вкладам в расчёт порога не включаются (104-ФЗ от 25.04.2026). Это снижает риск случайного превышения порога за счёт пассивного дохода.
Шаг 2. Уведомите налоговый орган об освобождении (если доход до 20 млн ₽)
Освобождение по ст. 145 НК РФ применяется в уведомительном порядке. Форму уведомления и точный срок его подачи уточните по действующим административным регламентам ФНС [VERIFY]. Важно: освобождение не означает полного выхода из-под НДС — при наличии операций, поименованных в ст. 149 НК РФ, соответствующие правила продолжают действовать.
При освобождении по ст. 145 НК РФ счета-фактуры выставляются с отметкой «Без НДС», вычеты по входящему НДС не применяются, декларацию НДС в большинстве случаев сдавать не требуется (за исключением агентских операций и ввоза товаров).
Шаг 3. Определите, какие операции покрыты льготой ст. 149
Разбейте выручку на два потока: льготные медицинские услуги (пп. 2 п. 2 ст. 149) и прочие облагаемые операции. Это разделение критично для раздельного учёта по ст. 170 НК РФ. Если льготные операции составляют 95% и более от общей выручки, действует правило «пяти процентов» — входящий НДС можно принять к вычету полностью без распределения. Применение правила пяти процентов и порядок его расчёта уточните по действующей редакции ст. 170 НК РФ [VERIFY].
Шаг 4. Выберите ставку НДС (если доход превышает 20 млн ₽)
Если вы плательщик НДС, для облагаемых операций выберите ставку:
- 5% (расчётная 5/105) — при доходах до 272,5 млн ₽ за год. Основание: пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ (176-ФЗ).
- 7% (расчётная 7/107) — при доходах от 272,5 до 490,5 млн ₽. Основание: пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ (176-ФЗ).
- 22% (расчётная 22/122) — при доходах свыше 490,5 млн ₽ или при добровольном выборе основной ставки. Основание: п. 3 ст. 164 НК РФ (425-ФЗ от 28.11.2025, с 01.01.2026).
Спецставки 5% и 7% связывают на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ). Отказаться досрочно нельзя — кроме случая, когда доход превысит лимит. При первом переходе на спецставку с 01.01.2026 действует окно однократного отказа в течение 4 налоговых периодов (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ). Воспользоваться окном стоит только если вы точно понимаете, что 22% с полными вычетами выгоднее.
Для медицины с преимущественно льготными операциями по ст. 149 выбор ставки для облагаемых операций (например, косметология, реализация медицинских товаров) чаще всего не принципиален по суммам. Но порядок её применения — обязателен.
Шаг 5. Настройте раздельный учёт
Если у вас есть и льготные (ст. 149), и облагаемые операции, раздельный учёт по ст. 170 НК РФ обязателен. Без него налоговый орган вправе лишить вас вычетов по всему входящему НДС. На практике раздельный учёт в медицине ведётся в разрезе видов деятельности: медицинские услуги (ст. 149) — отдельно, прочие — отдельно.
Входящий НДС по общехозяйственным расходам распределяется пропорционально выручке от облагаемых и необлагаемых операций. Методику закрепите в учётной политике до начала налогового периода — задним числом менять её нельзя.
Шаг 6. Выставляйте счета-фактуры правильно
По облагаемым операциям — счёт-фактура с выделенной суммой НДС (ст. 169 НК РФ). По льготным операциям ст. 149 и при освобождении ст. 145 — счёт-фактура с отметкой «Без НДС». Книга продаж ведётся по всем операциям, книга покупок — только по облагаемым. Электронный документооборот с ФНС — через оператора ЭДО.
Шаг 7. Сдайте декларацию и уплатите НДС в срок
Декларация НДС — только электронно, не позднее 25-го числа месяца, следующего за отчётным кварталом (п. 5 ст. 174 НК РФ). Уплата — тремя равными частями до 28-го числа каждого месяца квартала (п. 1 ст. 174 НК РФ). Просрочка декларации грозит штрафом по ст. 119 НК РФ: 5% от суммы налога за каждый полный или неполный месяц, максимум 30%, минимум 1 000 ₽. Неуплата НДС — штраф 20% по п. 1 ст. 122 НК РФ (40% при умысле — п. 3 ст. 122 НК РФ).
Не уверены, нужно ли вашей клинике или медцентру платить НДС с 2026 года? Это зависит от дохода за 2025 год, структуры услуг и выбора ставки — три параметра, которые определяют всё. Декларация за I квартал 2026 года подаётся до 25-го числа следующего месяца: если вы ещё не разобрались с режимом, времени меньше, чем кажется.
Разобрать ситуациюМатрица сценариев: ваша ситуация
- Медицинская клиника на УСН, доход за 2025 год — до 20 млн ₽
- Вы вправе применять освобождение по ст. 145 НК РФ. НДС с медицинских услуг не уплачивается. Необходимо подать уведомление в налоговый орган, выставлять счета-фактуры с отметкой «Без НДС», не заявлять вычеты. Риск: превышение порога в текущем году — тогда освобождение прекращается с месяца, в котором превышение произошло.
- Медицинская клиника на УСН, доход за 2025 год — от 20 до 272,5 млн ₽
- Вы плательщик НДС. Для льготных медицинских услуг применяется ст. 149 НК РФ — НДС нет. Для облагаемых операций (косметология, реализация товаров) доступна ставка 5% по пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ. Вычеты по входящему НДС при ставке 5% не применяются. Обязателен раздельный учёт по ст. 170 НК РФ. Декларация — электронно до 25-го числа по окончании квартала.
- Медицинская организация на УСН, доход за 2025 год — от 272,5 до 490,5 млн ₽
- Вы плательщик НДС. Для льготных операций — ст. 149. Для облагаемых — ставка 7% (пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ). Вычеты по входящему НДС при ставке 7% не применяются. Необходим раздельный учёт. Возможен переход на ставку 22% с полными вычетами, если входящий НДС по поставкам оборудования и расходных материалов делает это экономически выгодным — просчитайте до конца окна отказа (4 налоговых периода).
- Частный врач — ИП на УСН, оказывает только медицинские услуги
- Если доход за 2025 год не превысил 20 млн ₽ — освобождение по ст. 145. Если превысил — плательщик НДС, но медицинские услуги освобождены по ст. 149. Фактический НДС к уплате по основной деятельности будет равен нулю, но декларация, раздельный учёт и счета-фактуры обязательны. Проценты по вкладам в порог не включаются при доходе до 60 млн ₽ за 2025 год (104-ФЗ).
Типичные ошибки при переходе
На основе практики сопровождения медицинских организаций при переходе на НДС выделяются несколько устойчивых ошибок.
Смешение ст. 145 и ст. 149. Бухгалтер применяет ст. 145 как основание не платить НДС, при этом доход превышает 20 млн ₽. В итоге декларации не сдаются, счета-фактуры не выставляются — и при камеральной проверке возникает доначисление плюс штраф 20% (п. 1 ст. 122 НК РФ).
Отсутствие раздельного учёта. При наличии облагаемых и необлагаемых операций учёт не ведётся в разрезе видов деятельности. Налоговый орган отказывает в вычетах по всему входящему НДС. Для медицины, закупающей дорогостоящее оборудование, это может быть существенной суммой.
Неправильная квалификация косметологических услуг. Косметологические процедуры делятся на медицинские (лицензируемые, подпадающие под ст. 149) и косметические (не медицинские, облагаемые НДС). Граница проходит по наличию медицинской лицензии на конкретный вид деятельности. Объединение в учёте влечёт либо незаконное использование льготы, либо излишнюю уплату НДС.
Пропуск окна отказа от спецставки. Организация применила ставку 5% с I квартала 2026 года. Через два квартала стало ясно, что 22% с вычетами выгоднее из-за крупных закупок оборудования. Но окно — 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ). Если срок пропущен, спецставка связывает на 12 кварталов.
Что подготовить: чек-лист для медицинской организации на УСН
- Подсчитайте доход за предыдущий год по данным книги учёта доходов и расходов — сравните с порогом 20 млн ₽.
- Разбейте выручку на льготные медицинские услуги (ст. 149 НК РФ) и прочие облагаемые операции — это база для раздельного учёта.
- Проверьте наличие и актуальность лицензии на каждый вид медицинской деятельности — льгота ст. 149 работает только при наличии лицензии.
- Закрепите методику раздельного учёта в учётной политике до начала первого квартала применения НДС.
- Подключите оператора ЭДО для электронного документооборота с ФНС и контрагентами.
Из практики. Медицинский центр на УСН («доходы минус расходы») с выручкой около 35 млн ₽ за 2025 год. Основная деятельность — диагностика и терапия (лицензируемые медицинские услуги). Дополнительно — услуги косметолога без медицинской лицензии на эту конкретную процедуру (около 8% выручки).
При переходе на НДС с 2026 года бухгалтер первоначально применил ст. 149 ко всей выручке. После консультации выяснилось: косметологические услуги без лицензии под льготу не подпадают. Была выстроена система раздельного учёта, скорректирована учётная политика, на облагаемые услуги применена ставка 5%. Декларация за I квартал подана в срок; НДС к уплате — только с косметологических услуг, что составило незначительную долю от общей выручки.
«Меня это не касается, я на упрощёнке». С 1 января 2025 года упрощёнка не освобождает от НДС автоматически. 176-ФЗ от 12.07.2024 сделал всех плательщиков УСН плательщиками НДС. Единственный способ не платить НДС — применять освобождение по ст. 145 НК РФ (доход за прошлый год до 20 млн ₽) или иметь операции, полностью покрытые льготой ст. 149. Если ни то ни другое — возникает обязанность, которую проще выполнить правильно, чем получить штраф при проверке.
Уже наступил 2026 год, а структура НДС для вашей клиники или медцентра ещё не выстроена? Декларация подаётся до 25-го числа по окончании квартала — и первый период уже закрыт или закрывается. Чем позже выстраивается учёт, тем выше риск доначислений при камеральной проверке. Мы разберём структуру ваших услуг, определим, что попадает под ст. 149 и что облагается НДС, и настроим учёт.
Получить консультациюЧасто задаваемые вопросы
1. Как выбрать ставку НДС на УСН?
Выбор зависит от дохода за предшествующий год с учётом дефлятора 1,090. При доходах до 272,5 млн ₽ доступна ставка 5% (пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ), от 272,5 до 490,5 млн ₽ — ставка 7% (пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ). Для медицинских организаций важно учитывать, что большинство основных услуг может быть освобождено по ст. 149 НК РФ, и тогда выбор ставки для льготных операций не актуален. Для облагаемых операций ставку нужно выбрать до подачи первой декларации — спецставка связывает на 12 последовательных кварталов.
2. Как уведомить об освобождении от НДС?
Для освобождения по ст. 145 НК РФ (доход за предыдущий год не превысил 20 млн ₽ для упрощенцев) подаётся уведомление в налоговый орган. Форму и точный срок уточните по действующим административным регламентам ФНС [VERIFY]. После уведомления счета-фактуры выставляются с отметкой «Без НДС», вычеты не применяются.
3. Кто из упрощенцев платит НДС в 2026 году?
С 1 января 2025 года все плательщики УСН признаются плательщиками НДС (176-ФЗ от 12.07.2024). Освобождение получают те, чей доход за предыдущий год не превысил 20 млн ₽ (п. 1 ст. 145 НК РФ в редакции 425-ФЗ от 28.11.2025). В 2026 году порог остаётся на уровне 20 млн ₽ — он заморожен на несколько лет, конкретные годы дальнейшего снижения уточняются [VERIFY].
4. Нужно ли выставлять счета-фактуры на УСН?
Плательщики НДС на УСН (ставки 5%, 7% или 22%) обязаны выставлять счета-фактуры по ст. 169 НК РФ. При освобождении по ст. 145 НК РФ и по льготным операциям ст. 149 НК РФ счёт-фактура оформляется с отметкой «Без НДС». Счёт-фактура необходим и при освобождении — это требование НК РФ.
5. Что даёт освобождение по ст. 145 НК РФ?
Освобождение по ст. 145 НК РФ позволяет не исчислять и не уплачивать НДС, не подавать декларацию по НДС в большинстве случаев. Для медицинских организаций на УСН с доходом до 20 млн ₽ — это наиболее простой режим. Минус: вычеты по входящему НДС (оборудование, расходные материалы) не применяются. При значительных капитальных вложениях стоит просчитать, не выгоднее ли применять НДС со ставкой 22% и вычетами.
Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Для оценки конкретной ситуации обратитесь к специалисту.