Как выбрать ставку НДС: фармацевтика — расчёт и рекомендации

Опубликовано: 27 апреля 2026. Автор: Наталья Свияжская, эксперт по учёту и отчётности НДС.

Почему «я на упрощёнке» — больше не аргумент: что изменилось с 2026 года

Главное заблуждение, с которым к нам приходят фармацевтические компании и аптечные сети на УСН: «мы на упрощёнке, НДС не платим». С 1 января 2025 года это больше не так. Законом 176-ФЗ от 12.07.2024 все упрощенцы стали плательщиками НДС — по умолчанию, автоматически, без специального перехода.

С 1 января 2026 года реформа усилилась: основная ставка НДС повышена до 22% (расчётная 22/122; п. 3 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ от 28.11.2025). Одновременно установлен порог освобождения для УСН — 20 млн руб. дохода за предыдущий год (п. 1 ст. 145 НК РФ, 425-ФЗ). Для среднего и крупного малого бизнеса в фармацевтике этот порог пройден ещё в 2024–2025 году.

Что это означает на практике: если в 2025 году вы заработали больше 20 млн руб. — с 1 января 2026 года вы обязаны начислять НДС, выставлять счета-фактуры и сдавать декларацию. Единственный вопрос — по какой ставке и с каким правом на вычет. Именно здесь для фармацевтики скрыта существенная экономия или, наоборот, скрытые потери.

Шаг 1. Проверьте, есть ли у вас право на освобождение

Прежде чем считать ставки, нужно ответить на один вопрос: имеете ли вы право не платить НДС вовсе. Такое право даёт ст. 145 НК РФ. Для упрощенцев порог с 2026 года — 20 млн руб. дохода за предыдущий год (425-ФЗ от 28.11.2025).

Если ваш доход за 2025 год не превысил 20 млн руб. — вы вправе подать уведомление об освобождении и не начислять НДС. Это самый простой путь: нет НДС к уплате, нет декларации, нет счетов-фактур (выставлять их при освобождении запрещено — иначе возникает обязанность уплатить НДС с суммы счёта). Обратная сторона: входящий НДС от поставщиков вы не принимаете к вычету, а включаете в стоимость товаров и расходов. Для аптеки, работающей с крупными дистрибьюторами, это может быть существенно.

Порядок уведомления — форма подаётся в налоговую инспекцию до начала квартала, с которого применяется освобождение. Конкретную форму и точный срок уточните в действующих приказах ФНС.

Когда освобождение невыгодно для фармацевтики: если ваши поставщики — крупные дистрибьюторы на ОСНО, которые выставляют вам счета-фактуры с НДС 10%, и эта сумма существенна в вашем обороте. В такой ситуации потеря права на вычет «съедает» всю экономию на неуплате НДС.

Шаг 2. Разберитесь с ассортиментом: ставка 10% или 22%

Фармацевтика — один из немногих секторов, где большинство реализуемых товаров облагается не по стандартной, а по льготной ставке 10%. Это принципиальная особенность, которая меняет всю экономику выбора режима.

По ставке 10% (расчётная 10/110; п. 2 ст. 164 НК РФ) облагаются:

• лекарственные препараты, включённые в перечень, утверждённый Правительством РФ, в том числе препараты, изготавливаемые аптечными организациями;
• медицинские изделия из перечня, утверждённого Правительством РФ (за исключением важнейших и жизненно необходимых, которые могут облагаться по ставке 0% при соблюдении условий);
• ряд продуктов лечебного питания.

По ставке 22% (расчётная 22/122; п. 3 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ от 28.11.2025) облагаются:

• БАДы, косметика, парафармацевтика — если они не входят в перечни Правительства по ст. 164;
• услуги: доставка, фасовка, консультационные и иные сопутствующие услуги;
• медицинские изделия, не включённые в льготный перечень.

Практический вывод: если ваш ассортимент на 80–90% состоит из препаратов и медизделий из перечней, основная нагрузка по НДС у вас — это 10%, а не 22%. Это радикально меняет расчёт выгоды спецставки.

Шаг 3. Рассчитайте экономику трёх вариантов

Для упрощенца в фармацевтике, чей доход превышает 20 млн руб., реально три пути. Разберём каждый.

Вариант А. Спецставка 5% (без вычетов)

Спецставка 5% (расчётная 5/105; пп. 1 п. 8 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ) доступна, если доход не превышает 272,5 млн руб. в 2026 году (лимит с учётом дефлятора 1,090; п. 8–9 ст. 164). Вы начисляете 5% на всю реализацию, входящий НДС от поставщиков к вычету не принимаете — он включается в стоимость.

Когда выгодно: если входящий НДС от поставщиков невелик (вы покупаете у упрощенцев, работаете с импортными товарами напрямую по таможенным схемам без российского НДС, или ваши поставщики сами на освобождении). В таком случае потеря вычета не критична, а 5% вместо 10%/22% — существенная экономия.

Когда невыгодно: ваши дистрибьюторы выставляют НДС 10% на основной ассортимент. Допустим, входящий НДС составляет 8% от оборота — вы теряете 8% к вычету, а платите 5%. Итог: фактическая нагрузка выше, чем при стандартном режиме.

Важно: спецставка 5% связывает вас на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ). Для впервые применяющих с 2026 года — окно однократного отказа составляет 4 налоговых периода (абз. 2 п. 9 ст. 164, 425-ФЗ). То есть минимум год поэксперименировать можно, но затем фиксация жёсткая.

Вариант Б. Спецставка 7% (без вычетов)

Спецставка 7% (расчётная 7/107; пп. 2 п. 8 ст. 164 НК РФ) применяется при доходе от 272,5 до 490,5 млн руб. в 2026 году. Логика та же, что у 5%, — нет вычетов, нет права перейти на стандартный режим до истечения 12 кварталов (кроме окна отказа в 4 периода для новых плательщиков).

Для фармацевтики это редко выгоднее стандартного режима при высокой доле льготного товара с НДС 10% у поставщика: вы платите 7% без вычета против эффективной нагрузки «10% минус вычет 10%» — то есть фактически 0% при паритетных закупочных и продажных ценах.

Вариант В. Стандартная ставка 10% / 22% с вычетами

Работа по стандартным ставкам: 10% на льготный ассортимент (препараты, медизделия из перечня), 22% на прочее. Входящий НДС принимаете к вычету в полном объёме (ст. 171–172 НК РФ). При совмещении ставок обязателен раздельный учёт (ст. 170 НК РФ).

Когда выгодно для фармацевтики: ваши поставщики — оптовые дистрибьюторы на ОСНО, выставляющие НДС 10% на большинство позиций. Торговая наценка умеренная. Входящий НДС составляет значительную долю от продажного НДС — вычет существенен.

Ориентир для расчёта: если ваша торговая наценка менее 50% на основной ассортимент, стандартная ставка с вычетами, как правило, выгоднее спецставки 5/7%. При наценке 100% и выше — спецставка может быть привлекательнее. Точный расчёт — индивидуально, с учётом вашего ассортимента, наценки и структуры поставщиков.

Шаг 4. Проверьте дополнительные факторы для фармацевтики

Помимо базового расчёта, у фармацевтического бизнеса есть специфические факторы, которые влияют на выбор режима.

Импортные закупки. Если вы импортируете препараты напрямую, НДС уплачивается при ввозе на таможне. Этот «ввозной» НДС принимается к вычету только при работе на стандартной ставке. При спецставке 5%/7% таможенный НДС — это ваш чистый расход, без вычета. При значительных объёмах импорта стандартная ставка с вычетом почти всегда выгоднее.

Покупатели — юридические лица и государство. Если ваши ключевые клиенты — больницы, медицинские учреждения на ОСНО, государственные контракты — они ожидают счёт-фактуру с НДС и могут требовать стандартную ставку для собственного вычета. При спецставке счёт-фактура выставляется, но покупатель не может принять её НДС к вычету. Это может осложнить тендерные конкурентные условия.

Льгота по ст. 149 НК РФ. Отдельные операции в фармацевтике освобождены от НДС по ст. 149 НК РФ: реализация ряда медизделий (важнейших и жизненно необходимых), отдельных услуг медицинского характера. При применении льготы по ст. 149 счёт-фактура выставляется с пометкой «без НДС», раздельный учёт обязателен.

Общепит. Если вы совмещаете аптеку с кафе или зоной питания — с 2026 года для общепита действует продлённое освобождение по 104-ФЗ от 25.04.2026. Уточните условия применительно к вашей ситуации.

Шаг 5. Зафиксируйте выбор и организуйте учёт

Выбор сделан — теперь важно его правильно оформить и выстроить учёт. Ошибки на этом шаге приводят к доначислениям и штрафам.

Для освобождения по ст. 145: подайте уведомление в ИФНС. После этого не выставляйте счета-фактуры с НДС — это распространённая ошибка, которая автоматически создаёт обязанность уплатить НДС с суммы такого счёта (п. 5 ст. 173 НК РФ).

Для спецставки 5% или 7%: право применяется с уведомлением в ИФНС. Помните о фиксации на 12 кварталов — пересчитайте заранее, насколько вы уверены в выгодности этого выбора на горизонте трёх лет. Счета-фактуры выставляются со ставкой 5% или 7%, но покупатель на ОСНО не вправе принять их к вычету в стандартном порядке.

Для стандартной ставки при смешанном ассортименте: раздельный учёт — обязателен (ст. 170 НК РФ). Каждая товарная группа с разной ставкой учитывается отдельно. Декларация по НДС сдаётся не позднее 25-го числа месяца, следующего за истёкшим кварталом (п. 5 ст. 174 НК РФ). Уплата — до 28-го числа, тремя равными частями в течение квартала (п. 1 ст. 174 НК РФ).

Счёт-фактура на УСН: при любой ставке (кроме освобождения) счёт-фактура выставляется в общем порядке по ст. 169 НК РФ. Реквизиты — стандартные: ставка, сумма налога, стоимость с налогом. Электронный формат — в соответствии с форматом ФНС уточните по действующей редакции.

• Проверить доход за 2025 год и сравнить с порогом 20 млн руб. (п. 1 ст. 145 НК РФ, 425-ФЗ)
• Классифицировать ассортимент: какие позиции — льготный перечень 10%, какие — 22%, какие — льгота ст. 149
• Рассчитать входящий НДС от ключевых поставщиков за последний год — это основа для сравнения вариантов
• Выбрать и зафиксировать режим: уведомление об освобождении или уведомление о выборе спецставки — до начала квартала применения
• Организовать раздельный учёт (если совмещаете ставки или ст. 149), настроить выставление счетов-фактур по новым правилам

Типичные ошибки при выборе ставки НДС в фармацевтике

Из практики сопровождения перехода фармацевтических компаний на НДС — несколько ошибок, которые встречаются чаще всего.

Ошибка 1. Выбор спецставки без расчёта входящего НДС. Компания видит «5% — это мало» и выбирает спецставку, не посчитав, сколько входящего НДС она теряет к вычету. Для аптеки с оборотом 100 млн руб. и закупками от дистрибьюторов с НДС 10% потеря вычета составляет около 7–8 млн руб. в год. Это больше, чем экономия на разнице ставок.

Ошибка 2. Выставление счёта-фактуры при освобождении. Бухгалтер по привычке выставляет счёт-фактуру с НДС крупному покупателю. Результат: обязанность уплатить НДС с этой суммы (п. 5 ст. 173 НК РФ) — при том что права на вычет входящего НДС нет. Двойные потери.

Ошибка 3. Отсутствие раздельного учёта. Смешанный ассортимент (препараты по 10% + парафармацевтика по 22%) без раздельного учёта — это основание для отказа в вычете по всему НДС и доначислений по ст. 170 НК РФ. При проверке инспекторы запрашивают аналитику по ставкам за весь период.

Ошибка 4. Неверная классификация ассортимента. Часть компаний относит к льготному перечню позиции, которых в нём нет — например, отдельные косметические средства с «лечебным» позиционированием. Инспекция доначисляет разницу между 10% и 22% плюс штраф и пени. Перечни нужно сверять с действующими постановлениями Правительства.

Ошибка 5. Игнорирование 12-квартального периода спецставки. Компания выбирает спецставку 5%, а через год понимает, что ей стало невыгодно. Но право перейти на стандартную ставку появится только через 12 кварталов (три года) — если окно отказа в 4 периода уже использовано или не применимо.

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Нормативное регулирование НДС активно меняется; уточняйте актуальную редакцию норм НК РФ перед принятием решений.