Декларация по НДС для упрощенца: фармацевтика

19 мая 2026  ·  Виктор Аршинов, эксперт по НДС

Почему упрощенец-фармацевт теперь точно плательщик НДС

Возражение «меня это не касается, я на упрощёнке» уже не работает. Федеральный закон 176-ФЗ от 12.07.2024 включил организации и ИП на УСН в перечень налогоплательщиков НДС. С 2025 года переход произошёл для большинства, а с 2026 года — с учётом обновлённых порогов по 425-ФЗ от 28.11.2025.

Ключевое правило: если доходы за предыдущий год не превысили 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ в редакции 425-ФЗ), упрощенец вправе применить освобождение от НДС и не подавать декларацию. Если превысили — обязанность начислять налог, выставлять счета-фактуры и сдавать декларацию возникает автоматически. Никакого заявления о «вступлении» в НДС не нужно — система переключается по факту превышения порога.

Для фармацевтического бизнеса на УСН это особенно актуально: аптечная сеть из трёх точек, дистрибьютор медизделий или небольшой производитель БАД легко перешагивает отметку 20 млн рублей выручки за год. И тогда встаёт вопрос: как правильно заполнить декларацию по НДС и не потерять на ставках.

Шаг 1. Определить свой статус: освобождение или плательщик

Первое, что нужно сделать, — сверить доходы за 2025 год с порогом 20 млн рублей. Это не выручка по КУДИР за отдельный квартал, а совокупный доход за весь предыдущий календарный год. Для ИП важная оговорка: с апреля 2026 года в расчёт не включаются проценты по банковским вкладам (104-ФЗ от 25.04.2026) — это снижает итоговый доход и может сохранить право на освобождение.

Если доходы за 2025 год не превысили 20 млн рублей — подать уведомление об освобождении. Механизм: направить уведомление в налоговый орган в установленной форме не позднее срока, предусмотренного п. 3 ст. 145 НК РФ (точный срок подачи уточните по действующей редакции). В периоде освобождения НДС не начисляется, декларация не подаётся, счета-фактуры выставляются с отметкой «Без НДС».

Если доходы превысили 20 млн рублей — освобождение недоступно. Далее нужно выбрать ставку НДС.

Шаг 2. Выбрать ставку НДС — спецставка или стандарт

Если освобождение недоступно, у упрощенца три варианта. Выбор фиксируется на 12 последовательных кварталов (п. 9 ст. 164 НК РФ, 176-ФЗ) — изменить решение в середине периода нельзя.

Важно: при применении спецставок 5% или 7% входной НДС к вычету не принимается. Это прямое условие п. 8 ст. 164 НК РФ. Для фармацевтики, где поставщики — крупные дистрибьюторы на ОСНО, выставляющие счета-фактуры с НДС 10% или 22%, потеря вычетов может оказаться дороже, чем разница в ставках. Считайте прежде чем выбирать.

Шаг 3. Льготная ставка 10% в фармацевтике — условия и риски

Ставка 10% для лекарственных средств — одна из немногих льгот, которая сохранилась в реформе-2026. Но применять её нужно аккуратно: налоговые органы при камеральных проверках деклараций с пониженными ставками запрашивают подтверждающие документы по ст. 88 НК РФ.

Условия применения ставки 10% по пп. 4 п. 2 ст. 164 НК РФ:

• Товар включён в перечень лекарственных средств, утверждённый Правительством РФ (перечень периодически обновляется — сверяйте актуальную редакцию).
• Лекарственное средство зарегистрировано в установленном порядке (регистрационное удостоверение действует на дату реализации).
• Реализация идёт именно как лекарственного средства, а не как компонента или иного товара с другим кодом ТН ВЭД.

Ставка 10% не распространяется автоматически на все товары аптечного ассортимента. Косметика, БАД, парфюмерия, медицинская одежда, некоторые изделия медназначения — это отдельные перечни и отдельные условия. По товарам вне льготного перечня применяется ставка 22% (с 01.01.2026 по п. 3 ст. 164 НК РФ, 425-ФЗ). Смешение ставок без раздельного учёта — прямой путь к доначислениям.

Шаг 4. Раздельный учёт — без него вычеты снимут полностью

Если фармацевтический упрощенец применяет стандартные ставки и реализует товары с разными ставками НДС (0%, 10%, 22%), он обязан вести раздельный учёт операций по ст. 149, 170–172 НК РФ. Без него входной НДС распределить по видам деятельности невозможно, и налоговый орган вправе снять вычеты полностью.

Как это работает на практике. Аптека или дистрибьютор продаёт:

• Лекарственные средства по перечню — ставка 10%;
• БАД, косметику, парафармацевтику, медодежду — ставка 22%;
• При наличии экспортных поставок — ставка 0% с подтверждением по ст. 165 НК РФ.

Для каждого вида операций ведётся отдельный учёт в книге продаж. Входной НДС от поставщиков распределяется пропорционально выручке по каждой ставке — либо по утверждённой методике в учётной политике. Учётная политика должна быть закреплена до начала налогового периода: менять правила распределения задним числом нельзя.

Шаг 5. Заполнение декларации по НДС: разделы и сроки

Декларация по НДС подаётся в электронной форме через оператора ТКС — исключений для упрощенцев нет (п. 5 ст. 174 НК РФ). Срок: 25-е число месяца, следующего за истекшим кварталом.

Основные разделы декларации для фармацевтического упрощенца:

• Раздел 1 — итоговая сумма НДС к уплате (или к возмещению).
• Раздел 2 — заполняется, если организация выступает налоговым агентом (например, при аренде государственного имущества или покупках у иностранных контрагентов).
• Раздел 3 — операции по ставкам 22%, 10%, 22/122, 10/110. Здесь отражаются реализация лекарств по 10% и прочие товары по 22%, а также вычеты входного НДС.
• Раздел 4–6 — операции по ставке 0% (при наличии экспортных поставок); подтверждение по ст. 165 НК РФ.
• Раздел 7 — операции, не облагаемые НДС (льготы по ст. 149 НК РФ: например, реализация ЖНВЛП по регулируемым ценам в рамках отдельных программ — уточните применимость).

Уплата НДС — тремя равными частями, до 28-го числа каждого из трёх месяцев, следующих за кварталом (п. 1 ст. 174 НК РФ). Например, по декларации за I квартал 2026 года: по 1/3 до 28 апреля, 28 мая и 28 июня.

Шаг 6. Счета-фактуры: обязательны, но с нюансами

Упрощенец-плательщик НДС обязан выставлять счета-фактуры по ст. 168–169 НК РФ. Это не просьба — это условие, при нарушении которого покупатель теряет вычет, а у продавца возникают риски при проверке.

В фармацевтике важно правильно указывать ставку НДС в счёте-фактуре: отдельно по позициям с 10% (лекарства из перечня) и отдельно по позициям с 22% (прочие товары). Смешение ставок в одном счёте-фактуре допустимо — но каждая строка должна содержать верную ставку и сумму налога. Расчётная ставка 10/110 применяется при получении авансов в счёт предстоящей реализации товаров, облагаемых по 10%.

При применении освобождения по ст. 145 НК РФ счета-фактуры с НДС не выставляются. Можно оформлять счёт-фактуру с пометкой «Без НДС» — тогда покупатель понимает статус продавца. Если по ошибке выставить счёт-фактуру с выделенным НДС в период освобождения — возникает обязанность уплатить этот НДС в бюджет (п. 5 ст. 173 НК РФ), даже без права на вычеты.

Типичные ошибки при первой декларации

Разбираю наиболее частые проблемы, с которыми сталкиваются фармацевтические упрощенцы при подаче первой декларации по НДС.

• Сверить доходы за предыдущий год с порогом 20 млн рублей (п. 1 ст. 145 НК РФ, 425-ФЗ).
• Выбрать ставку НДС (5% / 7% без вычетов или стандартные 10%/22% с вычетами) и зафиксировать в уведомлении до начала периода.
• Проверить перечень лекарственных средств для применения ставки 10% — регистрационные удостоверения должны быть действующими.
• Утвердить учётную политику с методикой раздельного учёта по ставкам НДС до начала квартала.
• Настроить раздельный учёт в учётной программе: операции 0%, 10%, 22% — в отдельных регистрах.

Материал носит информационный характер и не является юридической консультацией. Нормы приведены по состоянию на дату публикации; перед принятием решений сверяйте с актуальной редакцией НК РФ.